Генетическое разнообразие вируса PRRS является результатом мутация и выборНо и рекомбинация:
- Случайные мутацииЧастота мутаций вируса PRRS считается самой высокой до сих пор для вируса, будучи до 40 раз выше, чем скорость мутаций известных вирусов, таких как вирусы. Вирус гриппа птиц или Вирус иммунодефицита человекаКак и другие РНК-вирусы, вирус PRRS имеет РНК-полимеразу, не обладающую способностью исправлять присущие ей общие ошибки, возникающие при транскрипции РНК. Поскольку эти ошибки появляются каждые 100-1000 нуклеотидов, каждый новый вирус может отличаться от предыдущего. Как следствие, вырабатывается ряд новых вирусных вариантов PRRS с нуклеотидными последовательностями, отличными от родительских. У инфицированных свиней вирус PRRS существует как облако, рой или распространение разнообразных вариантов вирусов, связанных сходными мутациями, которые в совокупности способствуют вариациям, конкуренции и селекции. Это распределение известно как квазивид и происходит независимо от штамма и хозяина. Иммуномодулирование и эволюция квазивидов, как предполагается, играют решающую роль в вирусной инфекции PRRS и ее хроническом/постоянном течении.
- рекомбинация В некоторых случаях различия между штаммами вируса PRRS настолько велики, что практически невозможно принять, что эти различия происходят исключительно от мутации. Аналогичным образом, мутации сами по себе не могут объяснить наличие делеций и вставок в многочисленных местах вдоль генома вируса PRRS. Действительно, когда были исследованы полноразмерные последовательности генома, события рекомбинации часто обнаруживались по всему геному у обоих видов, указывая на это явление как очень важное для объяснения генетического разнообразия вируса PRRS.
